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Micron Document

<!DOCTYPE html>

</head>

</header>

</div>

<th colspan="2" style="font-size: 105%;">POEM@home

</th></tr>

<tr>

</td></tr>

<tr>

<th>Bereich:

</th>

<td><a href="Biochemie" title="Biochemie">Biochemie</a>

</td></tr>

<tr>

<th>Ziel:

</th>

<td>Analyse und Vorhersage der <a href="Proteinstruktur" title="Proteinstruktur">Proteinstruktur</a>

</td></tr>

<tr>

<th>Betreiber:

</th>

<td><a href="Karlsruher_Institut_f%C3%BCr_Technologie" title="Karlsruher Institut für Technologie">Karlsruher Institut für Technologie</a>

</td></tr>

<tr>

<th>Land:

</th>

<td><a href="Deutschland" title="Deutschland">Deutschland</a>

</td></tr>

<tr>

<th>Plattform:

</th>

<td><a href="Berkeley_Open_Infrastructure_for_Network_Computing" title="Berkeley Open Infrastructure for Network Computing">BOINC</a>

</td></tr>

<tr>

<th>Website:

</th>

<td><a rel="nofollow" class="external free" href="http://boinc.fzk.de/poem">http://boinc.fzk.de/poem</a>

</td></tr>

<th colspan="2" style="font-size: 105%;">Projektstatus

</th></tr>

<tr>

<th>Status:

</th>

<td>beendet

</td></tr>

<tr>

<th>Beginn:

</th>

<td>Oktober 2007

</td></tr>

<tr>

<th>Ende:

</th>

<td>Oktober 2016

</td></tr></tbody></table>

<p><b>POEM@home</b> (<b>P</b>rotein <b>O</b>ptimization with <b>E</b>nergy <b>M</b>ethods, Proteinoptimierung mit Energiemethoden) war ein <a href="Volunteer-Computing" title="Volunteer-Computing">Volunteer-Computing</a>-Projekt des <a href="Karlsruher_Institut_f%C3%BCr_Technologie" title="Karlsruher Institut für Technologie">Karlsruher Instituts für Technologie</a>, das mittels der Technik des <a href="Verteiltes_Rechnen" class="mw-redirect" title="Verteiltes Rechnen">verteilten Rechnens</a> versuchte, <a href="Proteinstruktur" title="Proteinstruktur">Proteinstrukturen</a> zu optimieren.

</p><p>Hierzu verwendete es ein atomares Modell für die freie Energie der <a href="Proteine" class="mw-redirect" title="Proteine">Proteine</a>, daher funktionierte POEM@home sowohl bei neuen <a href="Proteinfaltung" title="Proteinfaltung">Proteinfaltungen</a> als auch bei Anwendungen in der <a href="Nanobiotechnologie" title="Nanobiotechnologie">Nanobiotechnologie</a>, für die keine experimentellen Daten vorlagen.

Das Projekt wurde im Oktober 2007 gestartet. Die Basis der Berechnungen bildete die Software <a href="BOINC" class="mw-redirect" title="BOINC">BOINC</a> von der <a href="University_of_California%2C_Berkeley" title="University of California, Berkeley">University of California, Berkeley</a>. Zum Schluss lag die Rechenleistung des Projekts bei ungefähr 739 <a href="FLOP" class="mw-redirect" title="FLOP">TeraFLOPS</a>,<sup id="cite_ref-1" class="reference"><a href="#cite_note-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> die je nach Tagesleistung schwanken konnte.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Wissenschaftliche_Relevanz">Wissenschaftliche Relevanz</h2></div>

<p>Es wurde ein anderer wissenschaftlicher Ansatz zur Proteinfaltung als bei ähnlichen Projekten benutzt. Hierzu wurde <a href="Christian_B._Anfinsen" title="Christian B. Anfinsen">Christian B. Anfinsens</a> nobelpreisgekrönte thermodynamische Hypothese verwendet, die besagt, dass Proteine in ihrem biologisch aktiven Zustand eine minimale freie Energie haben. Die ansonsten üblichen, an Rechenzeit aufwändigen Simulationsprozesse wurden so durch viel schnellere Optimierungsprozesse ersetzt.<sup id="cite_ref-2" class="reference"><a href="#cite_note-2"><span class="cite-bracket">[</span>2<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>

</p><p>Nach kurzer Zeit konnte POEM@home schon erste Resultate vorweisen.<sup id="cite_ref-3" class="reference"><a href="#cite_note-3"><span class="cite-bracket">[</span>3<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>

Mit diesen Resultaten nahm das Projekt auch an dem alle zwei Jahre stattfindenden internationalen Forschungswettbewerb <a href="CASP" title="CASP">CASP</a> teil.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Ziele">Ziele</h2></div>

<p>POEM@home verfolgte folgende Ziele:

</p>

<ul><li>Vorhersage der biologisch aktiven Struktur von Proteinen</li>

<li>Verständnis der signalverarbeitenden Mechanismen während der Interaktion verschiedener Proteine miteinander</li>

<li>Verständnis von Krankheiten die auf Protein-Fehlfunktionen oder -<a href="Aggregation_(Chemie)" title="Aggregation (Chemie)">Aggregationen</a> beruhen</li>

<li>Entwicklung neuer Medikamente auf der Basis dreidimensionaler Strukturen biologisch wichtiger Proteine</li></ul>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Siehe_auch">Siehe auch</h2></div>

<ul><li><a href="Folding%40home" title="Folding@home">Folding@home</a></li>

<li><a href="Rosetta%40home" title="Rosetta@home">Rosetta@home</a></li>

<li><a href="SIMAP" title="SIMAP">SIMAP</a></li>

<li><a href="World_Community_Grid" title="World Community Grid">World Community Grid</a></li></ul>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Weblinks">Weblinks</h2></div>

<ul><li><a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.research.kit.edu/biostruct/">Offizielle Website der Projektgruppe</a></li></ul>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Einzelnachweise">Einzelnachweise</h2></div>

/* start https://de.wikipedia.org/ */

.mw-parser-output .webarchiv-memento a{color:inherit}

/* end https://de.wikipedia.org/ */

</style><a rel="nofollow" class="external text" href="https://web.archive.org/web/20140224011638/http://boinc.fzk.de/poem/server_status.php">POEM@home Server Status</a> (<span class="webarchiv-memento"><a href="Webarchivierung#Begrifflichkeiten" title="Webarchivierung">Memento</a></span> vom 24. Februar 2014 im <i><a href="Internet_Archive" title="Internet Archive">Internet Archive</a></i>)</span>

</li>

<li id="cite_note-2"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-2">↑</a></span> <span class="reference-text"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://web.archive.org/web/20071206020236/http://boinc.fzk.de/poem/forum_thread.php?id=4&nowrap=true#29">POEM-Forum</a> (<span class="webarchiv-memento"><a href="Webarchivierung#Begrifflichkeiten" title="Webarchivierung">Memento</a></span> vom 6. Dezember 2007 im <i><a href="Internet_Archive" title="Internet Archive">Internet Archive</a></i>)</span>

</li>

<li id="cite_note-3"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-3">↑</a></span> <span class="reference-text"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://web.archive.org/web/20080106141336/http://boinc.fzk.de/poem/index.php?section=resultpage">POEM@home</a> (<span class="webarchiv-memento"><a href="Webarchivierung#Begrifflichkeiten" title="Webarchivierung">Memento</a></span> vom 6. Januar 2008 im <i><a href="Internet_Archive" title="Internet Archive">Internet Archive</a></i>)</span>

</li>

</ol></div><div><div class="zim-footer">

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